校址在花蓮縣吉安鄉干城村吉安路六段60號。
學校位在木瓜溪畔北側，初英山東側，地處吉安鄉干城村與南華村交接處，台9丙線上。
「南華國小」的前身為1954年（民國43年）9月奉准開辦的「吉安國民學校南華分校」，設有2班。1956年（民國45年）8月獨立為「南華國民學校」，增至6班。學校校地原為台灣省種畜改良場提供的牧放用地，曾是木瓜溪流經的河床石礫。教室由原來茅草房舍、鐵皮、瓦蓋平房到現有三樓的校舍。本校為原住民重點學校。在2018年（107學年度），原住民學生41人，占總學生數51%，學生約六成為阿美族，四成為太魯閣族。
本校於1985年（民國74年）8月成立自立附設幼稚園，1989年（民國78年）8月更名為附設幼兒園。
隨後歷任校長陸續推動學校各項發展，包括校舍建設、活動中心、綜合球場與兒童遊樂場等設施。1990年代起積極發展本位課程與學生才藝，學童在足球、桌球、直笛等領域表現優異。2000年（民國89年）後，學校致力結合在地人文與產業推動多元課程，並透過藝術深耕計畫成立非洲鼓隊、烏克麗麗課程、西畫創作等課程活動。近年持續推動資訊數位課程、雙語教學、課室英語、食農教育，並改善校園硬體環境，如廁所整建完工。學校也積極參與地方公益演出，展現藝術特色與社區連結。
創校迄今（2025年）歷任校長共14位（含代理校長1位）：丘永昶、陳慶嘉、黃榮欽、林順發、邱阿倉、吳順貴、陳文達（代理）、邱家仁、陳芳文、饒忠、李國清、譚宇隆、蘇漢彬、吳惠貞。
據2025年（民國114年）統計，學生人數51名，開設班數6班，原住民族學生37人，以太魯閣族為主、阿美族其次，另有泰雅族、布農族；全校教職人員19名。
【圖1】1961年（民國50年）南華國民學校校舍。（南華國小提供）
【圖2】南華國民學校第一屆畢業照。（南華國小提供）
【圖3】2025年（民國114年）南華國小校舍平面圖。（南華國小提供）
【圖4】南華國小第67屆畢業照。（南華國小提供，2025年）
【圖5】南華國小校門。（南華國小提供，2025年）
參考文獻：