位於花蓮縣萬榮鄉馬遠村4鄰84號，隸屬布農中會。
1949年（民國38年）7月，胡文池牧師派卓溪鄉清水村許萬福到馬遠傳教。馬遠村最早歸信基督者是馬淑美（Salung Mangququ）、江木海夫婦。1950年（民國39年），胡文池牧師再派田光明、沈金標到馬遠村協助傳教工作，信徒人數增至49人，但苦無聚會場所，村中信徒分別到玉里、清水、瑞良、鳳林等教會禮拜。1951年（民國40年）1月，田本男提供其住宅作為禮拜聚會的場所，由太魯閣紅葉教會的牧者協助主禮；4月，有13位村民接受胡文池牧師施洗；11月，胡牧師再次造訪馬遠村，聚會者增至300人。田本男得知瑞穗鄉奇美村也有不少馬遠族人，便遷居奇美村傳教，後設立「奇美教會」，為本會第1個子會。
中華國民政府來台後，由於馬遠村民都住在山上的舊部落，交通不便。政府宣導村民遷移到交通方便的地點，教會也跟著遷到現址，重新蓋建茅草木板屋，此時信徒有350餘人。1954年（民國43年），信徒增至400人，改建禮拜堂為水泥平房，同年5月落成獻堂。當時本會信徒分散在東光、大馬園、馬遠等部落，東光和大馬園的信徒須耗時2小時遠道而來，因此在1965年（民國54年）設立「東光佈道所」，為本會第2個子會。東光部落、大馬園部落的信徒就近選在東光教會禮拜，本會信徒數從400多名降到200名。
1950-1964年（民國39-53年）期間，江清金派至馬遠教會任囑託宣道師，任內3次遷移教會、建堂。1965年（民國54年），花蓮區會派林秋水宣道師至本會服務，期間鼓勵信徒研讀《聖經》、羅馬字。後由吳聰文宣道師派到本會，強調詩班的訓練。1968年（民國57年），本會升格為堂會，田定義牧師為第1任駐堂牧師。1975-1984年（民國64-73年），聘任林雲祥牧師為駐堂牧師，任內成立儲蓄互助社、戒酒無名會、托兒所、推行擴建教堂等事工。1984年（民國73年），中會派顏乾坤傳道師為駐堂傳道師，隔年封立牧師，其任內成立青少年團契、社會青年團契，並強化母語，推行幹部訓練、聖經研究等事工。
本會迄今（2023年）歷任牧者不詳，已知有江清金、林秋水、吳總文、江清金、田定義、林雲詳、許美香、顏乾坤、魯傌夫．滿寇寇。
本會2021年有在籍會員398名，慕道友12名。
參考文獻：