日本統治後期，已有不少太魯閣族人接受了福音的宣揚，但由於日人禁止信仰基督教，因此族人只能在山上秘密地聚會。1945年戰爭結束後，渴望福音的太魯閣信徒湧向鄰近的平地教會作禮拜，其中以花蓮港教會最為壯觀，每個禮拜天有成千的族人不辭路途遙遠聚集在此，如此盛況被外國傳教士譽為是「近代的五旬節」。1946年，孫雅各牧師在花蓮設立了「山地聖經學園」（今玉山神學院的前身），第一屆學生28名中，多達17位為太魯閣族人。
於是，太魯閣族教會如雨後春筍般地迅速增長，到了1952年，因為教會漸漸增多（已有28所），部分人士認為時機成熟，可成立地方區域的教會組織。是以在該年2月23日在美崙山地聖經學園舉行禮拜，正式成立太魯閣區會，由田信德牧師擔任第一屆區會議長。太魯閣區會成立之後，首要任務之一就是向他族原住民傳道，因為太魯閣族是全臺灣最早歸主的原住民族群，自認有傳福音給其他族群的責任。太魯閣區會成立八年後，許多教會經濟已漸漸獨立，也任命不少牧師。經過總會會議通過決定，1960年7月在吉安教會舉行成立「太魯閣中會」感恩禮拜，此乃臺灣基督長老教會第一個成立的原住民中會，實為臺灣宣教歷史上重要一頁。
對臺灣社會、政治的關懷與參與，一直是臺灣基督長老教會一個令人印象深刻的標誌，太魯閣中會也同樣秉持此精神。中會底下的「教會與社會部」多年來舉辦、參與了許多極具社會關懷的活動，其中與太魯閣族人權益最密切相關的有以下三項：
（1）「反太魯閣國家公園」：1993年，秀林鄉各教會牧長、民意代表及地方人士一起推動「反太魯閣國家公園」遊行示威活動，參與者達二千多人，要求歸還原住民生存權和環境權。
（2）「反亞洲水泥侵占土地權」：參與秀林鄉還我土地自救會所舉辦的遊行、抗議活動，對亞洲水泥宣誓：「不要錢，還我土地！」
（3）「太魯閣族正名運動」：太魯閣中會於1996年11月18日，假花蓮農校禮堂舉辦「太魯閣族正名運動」研討會，開啟長達八年之太魯閣族正名運動的序幕。在太魯閣中會與其他領域族人的努力下，太魯閣族終於在2004年1月14日成為官方認定之臺灣原住民族的第十二族。
參考文獻：
