位於花蓮縣光復鄉大馬村中山路三段89巷14號，隸屬阿美中會。
1934年（昭和9年），淡水牛津學堂畢業的許南免宣道師（Afang），受北部大會派任至鳳林郡上大和（現今的光復鄉）地區傳教。起初宣教的對象是漢族，3年後卻引領3位阿美族人信主，也是馬太鞍部落的初信者。爾後，其中一人領其胞妹曾玉蘭（Linga'oping）入教，並於1936年（昭和11年）受薦入學淡水婦女學堂，2年學成後歸鄉，成為許南免最得力的助手。由於日本時代政府取締基督教，族人只得祕密聚會，迫使許南免於1944年（昭和19年）悵然離開上大和，隱居在玉里萬寧山區。在二次大戰前，上大和地區信仰基督的阿美族人已有50餘人之多。
1946年（民國35年），初代信徒召集家庭聚會，在鳳林教會徐復增牧師的協助下，建立起「光復教會」。解甲歸田的青年，如陳志豐、楊賢造、吳建豐、宋正清等人，紛紛進入玉山神學書院，畢業後也先後駐牧光復教會，馬太鞍部落幾乎全村歸主。不久，天主教傳入，導致宗派勢力變化。
1952年（民國41年），宋正清宣道師（'Afo'Apak）駐牧本會，持續蓬勃發展。他組織青年聖歌隊、光基西樂隊，並親自帶領前往阿美族部落，長期徒步宣教，促使花東地區的教堂迅速增多，光復教會因此被譽為阿美教會的「耶路撒冷」。
本會第3座教堂於1957年（民國46年）動土，施工期間經濟拮据、人事紛擾等問題接踵而至，致使工程延宕。直到許伊度牧師（Ido Kaniw）接任駐牧，鼓勵信徒重拾信心，最終於1966年（民國55年）舉行獻堂禮拜，正好與「基督教在台宣教100週年東部地區紀念大典」同時舉辦。許伊度牧師在獻堂後努力推動各項聖工，諸如阿美語文識字班、農民福音學校、婦女「福音話劇佈道隊」、引進「儲蓄互助社」，並建設「許南免牧師紀念館」。教會在沉寂1/4個世紀後，重啟部落的「豐年節慶」，重新融入部落文化，促進社區的融合與團結，也為社區宣教開啟了新的契機。
1981年（民國70年）起，每年舉行2屆的「東部基督徒禁食禱告退修會」吸引全國各地信徒來參加，盛況時幾乎達到6,000人次。會中不僅因應花東信徒的需求，興建教育館大樓，也製造大型鐵架、帳篷，並大量添購寢具。1987年（民國76年）舉行「東部基督徒祈禱院」的奠基感恩禮拜，此後祈禱院便作為東部地區信徒的祈禱場所。
1990年代（民國79年），禁食禱告退修會的熱潮開始減退，加上核心牧者之間的合作默契出現問題，東部基督徒祈禱院的建設責任最終由光復教會全權承擔。1995年（民國74年），獻堂禮拜時，祈禱院更名為「東部基督徒哈利路亞祈禱院」。然而，熱潮已逐漸消退，情況日益下滑。
1995年（民國84年），教會慶祝設教60週年慶典，開始尋思感恩節慶在地化的可行性，而後於1998年（民國87年）正式推行「本色化感恩節慶」，期盼振興阿美族文化。同年，教會也正式加入泰北阿卡族的宣教行列，1997年（民國86年）成立「松年大學光復分校」，為阿美中會的長者提供終身學習的機會。1999年（民國88年）起，教會每年參與觀光局縱管處的聖誕節燈會演出。此外，2001年（民國90年），教會與鄉公所合作興建部落教室，開放給族人、團體使用。
2002年（民國91）3月，許南免在榮退後，將牧養事業交付給擔任副牧7年的陳約翰牧師（Calaw Looh）手中。7月，教會孕育多年的「主日禮拜更新」計畫啟動，團契的轉型則於2003年（民國92年）啟程，注入阿美族傳統文化中「年齡階級」裡長幼有序、相互提攜、互助合作的元素、精神。同年7月，教會延攬「關懷牧師」宋美花（Hana'Oping）加入團隊，同時也設立「愛鄰關懷中心」，期望擴大服務的領域。
2004年（民國93年），本會歡慶設教70週年之際，從原本的「光復教會」更名為「馬太鞍教會」，象徵著身分的認同。2005年（民國94年），本會為照顧高齡會友，成立「老人日托關懷站」，也開始進入校園推展「得勝者課程」。2006年（民國95年），教會增聘3位全職的青少年輔導，開拓校園宣教的活動，也和機構協力開設「兒童課後陪讀班」，關心弱勢兒童。
本會於2007年（民國96年）實施多語言、多場次的禮拜，由雙語禮拜轉為上午的主日分為阿美母語、華語兩場，同年也正式開展監獄探訪事工。2008年（民國97年）舉辦傳愛嘉年華——社區聖誕聯歡活動，為當年主要的宣揚福音活動，吸引近2,000人次參加。
本會迄今（2023年）歷任牧者不詳，已知有許南免、曾玉蘭、陳志豐、楊賢造、吳建豐、宋正清、林生安、許伊度、陳約翰、宋美花、王傳祥。
本會2023年（民國112年）有在籍會員483名，慕道友91名。
參考文獻：