位於花蓮縣新城鄉康樂村大德街407號，隸屬阿美中會。
1962年（民國51年），曾任職於奇美教會的賴阿茂長老，離開奇美村老家遷至花蓮的北埔，在他來到前，北埔已有信徒，卻沒有人帶領聚會，因此賴阿茂長老到來後便主動探訪召聚，帶領信徒走到嘉里村的卡來萬教會禮拜。1963年（民國52年），北埔信徒開始在卡來萬教會聚會，當時的傳道是潘阿美宣道師。1966年（民國55年），多數信徒漸感交通不便，決定離開卡來萬回到北埔，租用信徒王興泉住宅作為聚會所。直到1970年1月，這期間的聚會都由賴阿茂長老負責，聚會人數大約14名。同年5月，在中美教會（後更名為迦琳谷教會）牧會的林進明宣道師，前來北埔協助牧會工作，本會也因此升格為「北埔佈道所」。
1978年（民國67年）2月，阿美中會鑒於林進明宣道師在本會開拓有成，正式派任林進明宣道師為首任傳道師。為了使信徒有教會聚會禮拜，林進明宣道師與長執洽商，也得到平地教會首肯，從3月起借用平地教會，兩會同用一間禮拜堂聚會，直到1985年（民國74年）9月。1980年（民國69年），林進明宣道師任期屆滿離任。1981年（民國70年）7月，甫自玉山神學院畢業的洪玉妹傳道師到本會牧會，任內教會事工逐漸發展。當時北埔地區阿美族移入人口增加，根據1982年（民國71年）的統計，陪餐會員44名，慕道友42名，兒童31名。每主日禮拜人數平均約20名。
1983年（民國72年）7月，洪玉妹傳道因待產休假，由張明佑牧師代理牧會。翌年6月，本會定名為「北星基督長老教會」。1985年（民國74年）9月，本會自北埔社區遷移到華陽社區，租屋華興街172號為禮拜場所。10月，阿美中會准林茂德傳道來本會牧會，正式到任就職。
1984年（民國73年）5月，召開臨時信徒和會，議決購買3棟國宅改建為教堂，6月開工，11月竣工。1986年（民國75年）7月本會升格為堂會，11月林茂德封立牧師，就任本會第1任牧師，12月本會遷至現址，並正式啟用新教堂，舉行第1次主日禮拜。1997年（民國86年），教會擴建時不慎占用他人土地，至2001年（民國100年）3月，終於貸款購買前庭占用的土地。
2002年（民國101年），承辦原住民青少年成長班，關懷社區兒童、青少年的課業，並開辦原住民社區大學。2004年（民國103年）4月，經小會同意，聘請剛從美國回台的高清玄牧師為副牧，掌理協會、松年事工。同年6月，設立「花秀原住民社區關懷協會」。2005年（民國104年）6月，本會與門諾基金會合辦老人日托班，透過每星期2天課程關懷社區老人。2006年（民國105年），阿美中會第44屆秋季會議通過教會更名為「巴扶以善教會」。
本會迄今（2023年）歷任牧者不詳，已知有林進明、林茂德、高清玄、李靜花、黃明宗、阿星阿曼。
本會2023年（民國112年）有在籍會員157名，慕道友0名。
參考文獻：