位於花蓮縣瑞穗鄉奇美村24號，隸屬阿美中會。
台灣基督長老教會有2間奇美長老教會，這是因為奇美部落有兩大族群，一為阿美族，另一為布農族所致。
1959年（民國48年）以前，奇美部落尚無基督徒，直到來自光復馬太鞍社的基督徒青年徐福壽（Fasa'）入贅奇美村，並開始以基督徒的身分傳教，吸引陳東岳（Payo）入教。起初，徐福壽向阿美族人傳教的過程並不順利，於是轉往布農族人傳教。後來全村的布農族人都成為基督徒，阿美族則僅有呂天德、林加榮兩家入信。
由於信徒人數不斷增加，於是在1959年（民國48年）搭建以茅草與竹木而成的禮拜堂。早期本會基督徒是阿美族、布農族人一起聚會禮拜，當時使用的語言是日語，唱的詩歌也是日本詩歌。然而後來因生活語言不同，隨著阿美族信徒人數逐漸增長，1960年（民國49年），兩族各自搭建竹造禮拜堂。阿美族奇美教會由徐福壽擔任首任長老，陳東岳擔任首任執事。早期的信徒有胡雲貴（Looh）、都文達（KacawNgafar）、賴阿木（Do`ec）、高吉本（Kakoyat）、林火生（`Orad）、陳萬德（Sera）、蔡彩妹（Saysay）、蔡清妹（Koli）、林茂全（Pahaw）、柯日祥（KacawTomon）、蔣國賢（KacawSawmah）、鄭成功（Komod）、KacawIpik、'OradSampa。
阿美族奇美教會分立後，先是暫借'OradSampa的住屋作為聚會所，隨後因空間不敷使用，於是另覓土地建堂。有一熱心信徒提供土地，即教會現址，教會在此搭建茅草屋教堂。由於茅草教堂常受到颱風侵襲而頻繁翻修，信徒開始籌募建堂經費。然而信徒大部分沒有現金收入，年輕人也未曾離開部落到外地工作賺錢，大多數是在家務農，於是會友把農作收成如稻米、花生、玉米等奉獻給教會，教會再變賣後換得現金，由此積累建堂基金。
1978年（民國67年），開始計劃興建鋼筋水泥教堂，邀請太巴塱教會的吳清雲牧師負責設計。當時瑞港公路尚未開通，許多建材如鋼筋、紅磚、水泥等，都是從瑞穗訂購後，經由秀姑巒溪運至奇美河邊，再以人力方式搬運至工地，從建材搬運到水泥攪拌，一切都是人工，完全沒有機器代勞。全體會友總動員，投入3個多月的時間終於完成今日的禮拜堂。
奇美教會由於過去未保留完整資料，許多事未能詳細考察。
本會迄今（2023年）歷任牧者不詳，已知有張雲錦、邱文基、黃傳武、張富田、吳鐵晃、楊富男、楊玉蓮、李學盛、鍾美枝、王永誠、拉爸斯‧伊木伊。
本會2022年（民國111年）有在籍會員89名，慕道友0名。
參考文獻：