位於南投縣埔里鎮愛蘭路45號，隸屬台中中會。
1871年（同治10年）烏牛欄社人潘開山武干打獵時受傷，傷勢嚴重，準備到外地求醫。途中住在大社女婿潘純熙的家中，經介紹後前往台南，由馬雅各醫生（Dr. James L. Maxwell）治療。期間，潘開山武干聽聞李豹傳道師講道進而信教；返回愛蘭後，潘開山武干向身邊親友傳教，並以茅草屋作為禮拜聚會所，更傳播基督信仰至牛眠、守城份、大湳白葉仔坑等地。
隨後，台南教士會派李庥牧師（Rev Hugh Ritchie）到愛蘭協助建造第一間禮拜堂，並以巴宰族社名命名，設立「烏牛欄禮拜堂」。因信徒日增，陸續設立「大湳禮拜堂」、「牛眠禮拜堂」，基督信仰從此於埔里奠基。
1880年（光緒6年），施大闢牧師（Rev David Smith）監工，新建第二間禮拜堂。1883年（光緒9年），本會升格為堂會，由英國宣教師主持聖禮。1905年（明治38年），曾持衡受封為本會首任牧師。1942年（昭和17年），禮拜堂屋頂破損，但警察不允許翻修而遭拆除。1945年（民國34年），羅文福牧師興建木造臨時禮拜堂。1948年（民國37年），更名為「愛蘭教會」。1953年（民國42年），潘勝輝長老、信徒黃萬益捐獻土地建堂。1956年（民國45年）第三間禮拜堂落成。1971年（民國60年），設教100週年，教會翻修並擴建主日學、幼稚園教室、牧師館、圍牆。1979年（民國68年）9月，成立蘭音合唱團，多次獲邀前往國內外各地演出，深獲好評。1981年（民國70年），舉辦設教110週年慶典，並興建靈修會館、圖書館、歷史館。1998年（民國87年），成立華語堂。
2003年（民國92年），本會與大湳教會、牛眠教會、台中神岡的大社教會、苗栗三義的鯉魚潭教會等5間以巴宰族群為主體的教會，共同成立「台灣巴宰族群文化協會」，致力於巴宰族文化的復興與傳承。
2021年（民國110年）12月，埔里基督教醫院念堂舉辦設教150週年禮拜。
愛蘭教會對於巴宰族語言文化的保存、凝聚族人認同感有重要意義。早期信徒以傳統歌謠的曲調領唱詩歌，或將祭祖歌曲編成聖詩詠唱，教會各項事工也與巴宰族的語言、文字、歌謠、文化緊密連結。巴宰語教學、巴宰族傳統祭儀「牽田走鏢」的復振等工作，主要成員多為愛蘭教會的巴宰信徒，儀式亦融合基督教儀式，呈現傳統祭儀與西方宗教的結合。
本會迄今（2022年）歷任牧者共有15位：曾持衡、吳天賜、施坦、羅文福、簡皆得、周燕全、趙信恩、謝多果、潘聰傑、盧文獻、陳哲男、羅仁貴、陳清恩、黃珮琪、吳炳正。
本會會友以巴宰族為主。
本會2022年（民國111年）有在籍會員430名，慕道友5名。
參考文獻：