位於花蓮縣卓溪鄉卓清村清水一鄰17號，座落於清水部落（Saiku），屬布農中會。
本教會沿革史分為宣教初期和教會創設發展期兩個部分。
（一）宣教初期
1945年（昭和20年）7月，卓溪鄉立山村太魯閣族Paizag Watan（おくやま﹝奧山﹞，許真信）被派為清水衛生所衛生員。由於日本人取締基督教，Paizang Watan利用晚上向村民傳講《聖經》故事。已信教的人，每週日晚與奧山徒步行走18公里到立山村聚會。
1945年（民國34年）戰後10月，奧山的傳道工作逐漸移至中平，不久便轉入真耶穌教。1946年（民國35年）5月，花蓮縣萬榮鄉馬遠村5戶人家遷至清水部落，其中一位太魯閣族Sazaku（潘素貞）為基督徒，至清水部落後，與信徒一起禮拜，並帶領約60幾位信徒步行6公里至東里教會或玉里教會禮拜。1947年（民國36年）5月，胡文池牧師帶領朱阿生長老、江天順牧師及駱先春牧師來清水部落舉行3天的佈道大會。胡牧師用日本語、布農族語佈道，吸引眾多村民前來。
（二）教會創設發展期
1948年（民國37年）1月，胡牧師召集每個村落2人代表，在玉里教會參加布農族語的羅馬字母拼音法研習5天。本村的代表是鄭明政（Tilu Istasipal）、沈金標（Sai-Taisnunan）和許萬福（Taing-daigaz Manququ）。研習會後，沈、許二人和潘素貞輪流帶領每晚的聚會，後又增加沈金福（Taisnunan），一共四人輪流主領禮拜。
1948年（民國37年）4月，長老朱阿生帶領信徒建造木造茅草屋。仝年6月建成，為本教會第一代教堂。由孫雅各牧師主持感恩禮拜，胡牧師選召沈金福成為本教會囑托宣教師，由他帶領著信徒參加各種聚會。1950年（民國39年）重建教會，以木板與磚塊重建禮拜堂，3月竣工，為本教會第二代教堂。是時重型機具尚未普及、建築技術不甚優良，一切工程都靠人力搬運，體現信徒對信仰的無私奉獻。
1978年（民國67年）3月，教會建築已不堪使用，故重建鋼筋水泥禮拜堂，為本教會第三代教堂。1986年（民國75年）12月興建兩層樓的牧育館。迄今（2019年）清水教會有兩棟建築物：一為禮拜堂，二為牧育館，教會周圍為水泥牆和鐵絲網，有鄉公所補助興建的司令台和現代化廁所。
本會歷任牧者共有11位：沈金福、沈金標、田貴興、田文徹、江清金、田定義、田榮順、王有道、張玉發、巴給‧搭給斯歐拉梵、顏美大。
本會信徒多為布農族巒群，2019年（民國108年）統計，信徒人數：在籍會員81人，不在籍4人；未陪餐會員小兒15人；慕道友5人；主日禮拜50人。
【圖一】清水教會外觀照。
【圖二】1948年（民國37年）清水教會第一代長老、執事合影。
【圖三】1950年（民國39年）教會第二代教堂建堂。
【圖四】2015年（民國104年）清水教會宣教七十週年合照。
參考文獻：