校址在花蓮縣萬榮鄉明利村明利35號。
學區包含Maribasi（馬里巴西部落，即俗稱的利華部落；明利村1-2鄰）、Mataangki（馬太鞍部落，即俗稱的明利中部落；明利村3-5鄰），以及Tngahan（大加漢部落，即俗稱的明利上部落；明利村6-8鄰）。
「明利國小」的前身為「Tngahan大加漢（太魯閣語之明利村）番童教育所」，位於碧赫潭（Langu Pihu）邊，學區包括現在的明利、萬榮兩村。1945年（民國34年）戰後，族人紛紛再遷移，「大加漢番童教育所」廢校。明利村的學生併入當時萬榮村地的「萬里國民學校」就讀。1959年（民國48年）8月1日在現址設立「萬榮國民學校明利分班」。1960年（民國49年）8月1日設為「萬榮國民學校明利分校」。1961年（民國50年）正式獨立為「明利國民小學」。本校為原住民重點學校。在2018年（107學年度），原住民學生46人，占總學生數100%，以太魯閣族為主。
2001年（民國90年）6月5日成立附設幼兒園。自2011年（民國100年）起向教育部申請本土語言（原住民族語）教學相關經費，進行太魯閣族語及文化教學。本校於2017年（民國106年）申請「原住民族委員會族語沉浸式幼兒園」計畫，並於隔年2018年（民國107年）奉准成立「原住民太魯閣族語沉浸式幼兒園」，全面性的以統整式的主題課程實施族語及民族文化教育。
創校迄今（2023年），歷任校長共12位（包含代理校長1位）：林興藤、涂雲祥、陳天堯、劉肇雲、徐添光、戴國健、賴東明、張秀珍（代理）、賴世豪、許進明、熊湘屏、胡永寶。
據2024年（民國113年）統計，有學生人數41名，開設班數6班，幼兒園學生人數21名，開設班數1班。學生皆為原住民。全校教職人員20名。
【圖1】1950年代設立分班前，勘查校地，規劃興建校舍。（明利國小提供）
【圖2】1950年代教職員及部落居民一同整理校地。（明利國小提供）
【圖3】明利國小舊校址。（明利國小提供）
【圖4】1960年代整修完成的校舍。（明利國小提供）
【圖5】1960年代明利國小運動會。（明利國小提供）
【圖6】1980年（民國69年）明利國小校舍。（明利國小提供）
【圖7】1974年（民國63年）明利國小第12屆畢業典禮。（明利國小提供）
【圖8】1970年（民國59年）明利國小鳥瞰圖。（明利國小提供）
【圖9】1980年（民國69年）師生至明利上部落遠足。（明利國小提供）
【圖10】明利國小西側司令台及自立樓教學大樓。一樓為部分科任教室及社區文健站使用；二樓為部分科任教室、傳統編藝教室及文物室使用。（胡永寶拍攝，2024年）
【圖11】明利國小校門。（胡永寶拍攝，2024年）
【圖12】明利國小樂學樓教學大樓。（胡永寶拍攝，2024年）
【圖13】明利國小附設幼兒園於學校西側小操場合照。（鍾大任拍攝，2024年）
參考文獻：