校址在花蓮縣卓溪鄉卓清村清水6號。
學校位在清水部落，鄰近秀姑巒溪上游的清水溪。布農族族人最初遷居於此，稱其為「Saiku」，意指「溪水流成S形大彎」。因大雨後洪水暴漲，隔日溪水迅速恢復清澈，故名「清水」。
「卓清國小」的前身為1921年（大正10年）1月成立的「清水教育所」。戰後定名為「卓清國民學校」。1968年（民國57年）實施九年國民教育，改名為「卓清國民小學」。2017年（民國106年）本校列為原住民重點學校。
本校在各類比賽中屢獲佳績，111-113學年度「太平洋盃全國中小學網路小論文專題暨本土使命式行動研究競賽」榮獲銅獎、金獎；112、113學年度花蓮縣師生鄉土歌謠比賽榮獲優等；2024年（民國113年）花蓮縣全縣暨全民社區聯合運動會競賽榮獲國小男生組鉛球第一名、國小男生組壘球擲遠第三名。
創校迄今（2024年）歷任校長共14位：張喜、曾財成、潘金成、李源清、彭作連、田清河、王盛運、潘永安、黃清亮、川夏蓮、賴健雄、曾淑珍、鄭嘉毅、劉千瑜。
據2024年（民國113年）統計，有學生人數24名，開設班數6班，全校教職人員13名。
【圖1】卓清國小校門張貼「花蓮縣端正禮俗宣導週」紅布條。（卓清國小提供，1970年代）
【圖2】卓清國小窗台張貼「端正禮俗宣導週特刊」海報。（卓清國小提供，1970年代）
【圖3】學生進行「端正禮俗宣導週作文比賽」。（卓清國小提供，1970年代）
【圖4】卓清國小創校百週年校慶暨布農傳統競技村校聯合運動會。（卓清國小提供，校門，2022年）
【圖5】卓清國小創校百週年校慶暨布農傳統競技村校聯合運動會。（卓清國小提供，司令台，2022年）
參考文獻：