校址在台東縣鹿野鄉瑞和村瑞景路三段1號。
學校位在台東縱谷東29線公路上，地處加典溪、鹿寮溪之間的沖積扇，鄰近瑞和車站。此沖積扇為日本時代所稱的大原地區，現分為瑞隆、瑞源、瑞河、瑞豐等4村，皆為本校學區。早期該地多為臺糖土地，為重要白甘蔗區。製糖產業式微，現多為林地。先民引卑南溪水開鑿豐源圳，現以生產稻米、紅甘蔗為主要作物。居民主要為閩南人、客家人、原住民，以阿美族為主。
「瑞源國中」的前身為1968年（民國57年）8月創立的「鹿野國民中學瑞源分部」。1969年（民國58年）8月奉准獨立設校為「瑞源國民中學」。
1968年（民國57年）實施九年國民教育，原則上每鄉鎮設一所國中。然而，鹿野鄉因鹿寮溪橫貫鄉內，將鄉域分為溪北大原、溪南鹿野兩部分，當時未有橋樑，交通不便，南北居民為設校權展開爭取，最終溪南獲得設校權。溪北地區學生需繞行新豐至省道再南下，長達8至9公里的路程，令部分家庭因經濟困難而放棄子女就學。大原地區士紳遂成立建校促進委員會，透過地方教育人士簡西東先生捐獻校地2.8公頃，加上國軍大隊長劉文清陪同促進會成員向省府主席黃杰陳情，最終促成溪北設校，鹿野鄉因此擁有兩所國中。
清國時代末期，阿美族由屏東、恆春遷入，逐漸形成部落，後來漢人也陸續移居。2014年（民國103年）本校列為原住民重點學校。早期學生人數較多，曾發展女壘，籃球、足球等運動團隊，近年發展反曲弓射箭運動項目團隊。2016年（民國105年）本校獲教育部閱讀磐石獎。配合新課綱，本校與社區合作發展校本課程「瑞源探索」，並融入童軍教育等課程。
創校迄今（2024年）歷任校長共12位：崔之安、蔡國榮、楊調勇、田正美、楊仲鏞、陳慕華、詹炳南、徐鎮遠、張新發、林銘欽、呂學興、陳登財。
本校創校，在初期有學生人數350名以上，開設班數12班，後因少子化、遷徙等因素，發展至2024年（民國113年），有學生人數15名，開設班數3班，全校教職人員16名，為台東人數最少的國中。
【圖1】簡西東先生捐贈瑞源國中校地。（陳登財提供）
【圖2】瑞源國中舊校門。（陳登財提供）
【圖3】瑞源國中新校門。（陳登財提供）
【圖4】瑞源國中校園空拍圖。（陳登財提供）
【圖5】童軍工程研習營。（陳登財提供）
【圖6】鄉土歌謠比賽。（陳登財提供）
【圖7】山野教育體驗，寶華-鸞山健行。（陳登財提供）
參考文獻：