校址在花蓮縣鳳林鎮長橋里長橋路1號。
學校占地約三公頃，因鄰近萬榮鄉，乃定名為萬榮國中。校地寬廣而環境優美，經歷任校長精心規劃與全體教職員工之努力經營，學校頗具林園之勝。建校初期學區包括鳳林鎮長橋、森榮2里，與萬榮鄉萬榮、明利2村。
「萬榮國中」創校於1968年（民國57年）。1983年（民國72年）9月，因森榮里「台灣省政府農林廳林務局木瓜林區管理處林田山場」裁撤，導致森榮里學生人數驟減。1988年（民國77年）8月，「森榮國小」隨之裁校，本校學生也僅容納「長橋國小」、「萬榮國小」、「明利國小」等畢業生，學生也從多元的族群，漸以太魯閣族學生為主體。本校因住戶人數原本就相對較少，加上少子化問題、交通日益便利，學生人數銳減，造成減班的困境。1997年（民國86年）起學校獲准實施專案編班，成為本縣第一所實施小班小校教學的國民中學。2019年（民國108年）學校持續減班，成為一所學生總數不到40名的3班小型學校。本校為原住民重點學校。在2018年（107學年度），原住民學生52人，占總學生數95%，以太魯閣族為主。
本校善用既有校舍空間申辦區域職業試探與體驗示範中心，並2019年（民國108年）成立花蓮縣第二所區域職業試探與體驗示範中心。位於花蓮縣中區的職探中心與「光復商工」、「花蓮高農」、「四維高中」合作，規劃辦理電子電機、農業與餐旅職群課程，並與在地業師或廠商合作，讓中區學子有更多機會提早進行職業探索活動。同時，推動與社區的連結，發展在地化的校本特色課程，實現互利與共榮。
學生在體育及樂舞方面的表現向來十分優異，歷年來在學校教師或教練的栽培下，無論是早期的原住民傳統歌謠、羽球、籃球或田徑等項目，抑或是近期開始發展的跆拳道、反曲弓射箭、傳統射箭等項目，學生皆有相當出色的表現。作為原住民重點學校，由於在民族教育的推展成效卓著，課程發展委員會於2019年（民國108年）核定將民族教育設為校本特色課程。
創校迄今（2024年）歷任校長共13位：潘松根、關仲謀、洪富盛、古桂村、簡富雄、方冬平、陳文財、楊志忠、沈居松、林東興、李秀珍、李淑婷、許瓊櫻。
學校規模，在初期1970年（民國59年）有學生人數約莫400名，開設班數9班，為全盛時期。至1988年（民國77年）有學生人數240名，自森榮國小裁校後，人數更逐年下滑。發展至2024年（民國113年）有學生人數34名，開設班數3班，原住民學生31名，占總學生數90%，原住民族群以太魯閣族為主，全校教職人員17名。
【圖1】2009年（民國98年）萬榮國中舊校舍。（萬榮國中提供）
【圖2】2015年（民國104年）萬榮國中新校舍。（萬榮國中提供）
【圖3】2022年（民國111年）萬榮國中區域職業試探與體驗示範中心。（萬榮國中提供）
【圖4】萬榮國中校門。（萬榮國中提供）
參考文獻：