位於屏東縣內埔鄉水門村中山路268號，隸屬排灣中會。
排灣族在日本時代信奉神道教，在日本政府戰敗離開後，崇尚泛靈信仰的排灣族人頓時失去精神依賴。1946年（民國35年），時任屏東教會的許有才牧師率領約40名信徒，帶著一袋鹽前往三地門部落，這正是福音傳入屏東排灣族原民部落的開始。1948年（民國37年）8月，三地門鄉馬兒村青年林泉茂成為第1位受洗的排灣族基督徒；9月，林泉茂與三地村青年許別江進入花蓮山地宣道所（玉山神學院前身）就讀。
1948年（民國37年），屏東教會差派黃素娥在三地村傳道、租屋舉辦聚會。同年村中展開建堂事工，並於1950年（民國39年）完成屏東排灣族第1座禮拜堂，此後排灣族各教會便如雨後春筍般於各村設立。1955年（民國44年），屏東教會舉行「山地區會」成立感恩禮拜，「屏東排灣區會」成立，這一年已有32間教會、22名傳道師。
1964年（民國53年）10月，屏東山地區會與總會山地宣道處，以及東部排灣區會，決議屏東山地區會與東部排灣區會合併為「排灣區會」，並選出第1屆中會組織。1966年（民國55年），由於排灣中會幅員遼闊，東部排灣族退出本會，成立「東部排灣區會」。
本會迄今（2023年）歷任牧者不詳，已知有議長：何清彌、謝勇、許石成、張生隆、葛良拜、葉素生、樂歌安．督達里茂、江思園、唐瑀穠、杜英傑、蔣明福、葛嘉雯。
參考文獻：